1、差減法：水樣分別被注入燃燒管和低溫反應管中,高溫燃燒管的水樣受高溫催化氧化,使有機化合物和無機碳酸鹽均轉化成為二氧化碳。反應管的水樣受酸化而使無機碳酸鹽分解成二氧化碳,其所生成的二氧化碳依次導入非分散紅外檢測器,從而分別測得水中的總碳和無機碳,總碳與無機碳之差值,即為總有機碳。

    2、直接法：將水樣酸化后爆氣,使各種碳酸鹽、分解生成二氧化碳而驅除后,注入高溫燃燒管中,可直接測定TOC。但由于在爆氣過程中會造成水樣中揮發性有機物的損失而產生測定誤差,因此,其測定結果只是未揮發的有機碳值。

    正確地使用與維護總有機碳分析儀設備就顯得格外重要，可以很好的提高儀器的使用壽命。